GÉNOMES DES CORONAVIRUS DU COVID-19, DU SRAS ET DES CHAUVES-SOURIS SÉQUENCES D’ARN HOMOLOGUES PARTICULIÈRES

GÉNOMES DES CORONAVIRUS DU COVID-19, DU SRAS ET DES CHAUVES-SOURIS SÉQUENCES D’ARN HOMOLOGUES PARTICULIÈRES

Pérez, JC Doctorat Maths § Informatique Université de Bordeaux, RETRAITE Chercheur Interdisciplinaire (IBM Emeritus, IBM European Research Center On Artificial Intelligence Montpellier), Bordeaux Métropole, France

EST CE QUE JE:

https://doi.org/10.29121/granthaalayah.v8.i7.2020.678

Résumé

Nous sommes confrontés à l’invasion mondiale d’un nouveau coronavirus. Cela fait suite à plusieurs épidémies limitées de virus apparentés à divers endroits dans un passé récent (SRAS, MERS).

Bien que le principal objectif actuel des chercheurs soit d’apporter des solutions thérapeutiques et préventives efficaces à la population mondiale, nous devons également mieux comprendre l’origine de l’épidémie induite par le nouveau coronavirus afin d’éviter de futures épidémies. Le présent bilan moléculaire consiste à étudier par une approche bio-informatique les faits relatifs au virus et à ses
précurseurs.

Cet article montre comment 16 fragments (gènes Env Pol et Integrase) de différentes souches, à la fois diversifiées et très récentes, des rétrovirus HIV1, HIV2 et SIV ont un pourcentage élevé d’homologie dans des parties du génome de COVID_19. De plus, chacun de ces éléments est constitué de 18 nucléotides ou plus et peut donc avoir une fonction. Ils sont appelés Eléments Informatifs Exogènes (EIE). Parmi ces EIE, 12 sont concentrés dans une toute petite région du génome du COVID-19, de longueur inférieure à 900 bases, soit moins de 3% de la longueur totale de ce génome. De plus, ces EIE sont positionnés dans deux gènes fonctionnels du COVID-19 : les gènes orf1ab et S spike. Voici les deux faits principaux qui contribuent à notre hypothèse d’un génome partiellement synthétique : Une région contiguë représentant 2,49 % de l’ensemble du génome COVID-19 dont 40,99 % est constitué de 12 fragments divers provenant de diverses souches de rétrovirus VIH SIV. Certains de ces 12 EIE apparaissent concaténés. Notamment, la partie rétrovirale de ces régions, constituée de 8 éléments issus de différentes souches
de HIV1, HIV2 et SIV couvre une longueur de 275 bases contiguës de COVID-19. La longueur cumulée de ces 8 éléments HIV/SIV représente 200 bases. Par conséquent, le taux de densité du VIH SIV de cette région de COVID-19 est de 200/275 = 72,73 %.

Téléchargements

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https://www.granthaalayahpublication.org/journals/index.php/granthaalayah/article/view/IJRG20_B07_3568

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